工程预算审计主要针对工程项目决算的，在一个建设项目竣工完成，建设单位与施工单位结算工程款时进行的。工程预算审计就是工程预算审核（审价），是工程预算咨询单位咨询业务的一部分。受业主委托对其工程项目的概算、预算及结算等，依据现行 政策法规、计价依据及相关工程技术资料对送审造价的工程量、单价及取费等进行逐项审核。在运用工程量清单计价模式进行工程预算审计工作时，可以从以下几个方面来进行：
工程预算对分包工程进行全过程跟踪审计是提高分包工程内审质量的主要途径。本文主要通过对分包工程审计质量要素的分析，从内部审计的可操作性和务实角度，提出了在分包工程审计思路和方法，对分包工程内审质量的提高进行了探讨。分包工程作为总承包工程的一个重要组成部分，对分包工程进行全过程跟踪审计主要是以合同为主线，通过事前参与、事中监督、事后评价的全过程跟踪，抓住招标竞价、合同签约、现场变更、材料供应、竣工结算等重点审计要素，实现对分包工程的全过程跟踪审计。
土建工程预算部分：
1、土方类别暂按三类土计入，挖土采用人工挖土，自然地面标高按-0.3m考虑，回填按就地回填考虑，回填后的土方全部外运；土方外运暂按陆域10km，处置费按甬价费（2021)119号文件执行；
2、主体混凝土按泵送商品混凝土考虑，砼垫层、圈、过梁、窗台板等按非泵送商品混凝土考虑，楼地面细石混凝土、散水、坡道等按现浇现拌混凝土考虑；
3、混凝土强度等级：砼基础垫层为C15根据项目质量计划、工程方案或工程图纸，预算部会同工程部拟定工程采购计划，预算部根据工程技术方案或工程图纸，概算工程量和工程造价，列出所属工程造价的类别：一万元以下；一万元至五万元（含伍万元）；五万元以上。
工程预算的工作内容：
1.竣工结束之后，着手准备竣工决算，收集和整理一切竣工决算的资料，汇总编制。
2.将所有工程联系单及现场经济签证单要全部并且签字盖章，某些文件 让老板出面解决。
3.竣工决算要做好三份，一份上报工程预算审计、一份上报领导、一份自己保留。
4.上报工程预算审计的决算尽可能放大10%以上，工程预算审计扣除的子目及工程量要心知肚明，不少于底线即可，另外莫须有的子目及工程量少的，尽量少吵。